Bon, il va être relativement facile de t'éclairer sur le sujet...

Tout d'abord, le résultat de ton test est tout à fait correct:
936,62 Mbps / 599,91 Mbps.
Le tout malgré un ping à 14 ms qui est un peu trop élevé, mais qui s'explique par le serveur un peu
exotique sur lequel il a été réalisé.
Il est préférable de sélectionner un serveur de test proche de ceux de Free et non de chez soi, comme ceux-ci:
- Orange France à Puteaux
- SFR à Trappes
- LaFibre.info BBR à Massy

Effectivement, tous les ports Ethernet du serveur Delta sont bridés à 1 Gbp/s et l'on ne peut rien y changer.

Non, il n'est absolument pas possible de
booster les ports via le portail Freebox OS.

Oui, tu peux avoir un débit plus élevé, mais il faut pour cela passer par le Port SFP+ du serveur et non pas les Ethernet.
Ta carte 2,5 Gbp/s pourrait fonctionner, mais il te faut un matériel intermédiaire du type
Switch 2 ports 10 SFP+, cité dans la colonne à droite de cette page.
Sinon, le plus simple reste de passer par une carte réseau dont le port d'entrée est en SFP+ et de prendre également le câble adéquat pour la relier au Delta.
Dans ton cas d'ailleurs, ton NRO étant éligible à la technologie PON, tu peux bénéficier du 10 Gbp/s, sur une seule machine, équipée comme indiqué.